يُعدّ البرنامج العلمي للمعهد من قِبل مجلسه العلمي، ثم يُعرض على مجلس تنسيق أعمال الأكاديمية للموافقة عليه. ويتفرع كل برنامج بعد ذلك إلى مجموعة من المشاريع تُنفَّذ بأشكال متعددة، مثل: أعمال بحثية، ندوات، مؤتمرات، موائد مستديرة، حلقات دراسية، منشورات، دورات تدريبية، مواد سمعية بصرية، وغيرها. وتُشكَّل لكل برنامج فريق بحثي يتولى تنفيذَه.