Le programme scientifique de l’Institut est élaboré par le conseil scientifique de l’Institut, puis soumis au conseil de coordination des travaux de l’Académie pour approbation. Chaque programme est décliné en projets qui sont réalisés sous forme de travaux de recherche, colloques, conférences, tables rondes, séminaires, publications, formations, supports audiovisuels, etc.  Une équipe de recherche est mise en place pour chaque programme.